昨日のDBCLS

先週アップロードしたGSEA softwareの使い方 基本編 統合TV(togotv)｜生命科学系DB・ツール使い倒し系チャンネルの続編。
DAVIDを使ってマイクロアレイデータを解析する 統合TV(togotv)｜生命科学系DB・ツール使い倒し系チャンネルと同じデータ(GSE1657)をOpenOfficeCalcで加工して、GSEAを走らせた。すると、LipidとかFattyAcid関連の遺伝子セットのスコアが高くなった。脂肪細胞分化前後の発現データなのでどうやらうまくいっているようだ。
あと、GSEA Prerankedという機能も発見した。次回調べる。