今日のDBCLS

Ensembl Tips ArrayExpress の遺伝子発現情報を表示する 統合TV(togotv)｜生命科学系DB・ツール使い倒し系チャンネルを仕上げた。
遺伝子の発現状況(どのくらい使われているか)を網羅的に調べられるArrayExpressというデータベースがある。今回はそのデータをEnsembl(ヒトゲノムや、マウスゲノム、などなど、がブラウズできるサイト)に表示する方法を紹介した。

リンクが一部機能しない

動画の最後にあるようにEnsembl内のリンクが一部機能していない。しかしどうやら1年前には正常に機能していたようだ。更新の速い生命科学系のサービスは、短い期間でもメンテナンスが行き届かなければそのような事象が起こってしまう。一つのサービスは別のサービスの機能に依存し、その別のサービスもまた別に依存関係を持っている。このようにして複雑に絡みあった依存関係のグラフができあがっている。この依存関係をすべて解決しつつ、サービスを更新することは非常に難しいだろう。